1、保障的对象不同，经济适用房的对象为中低收入家庭，公租房的对象为低保户。
2、保障的方式不同，经济适用房是低价格出售，公租房是廉价出租。
3、保障房的标准不同，经济适用房的建筑面积一般介于60平方米到90平方米之间，而公租房的建筑面积必须在50平方米之内。
4、经济适用房为毛坯房，公租房则可以拎包入住。经济适用房需要入住5年以后方能上市交易，而有些地区的公租房则可租可售。
经济适用房指的是政府主导建造的带有社会福利保障性质的商品住宅，具有非常显著的经济性和适用性两个特点。经济性体现在在价格方便比较便宜，能够适应于普通中低收入家庭的承受能力。适用性体现在强调住房的使用标准。
公租房的主要来源是政府提供支撑政策，社会组织通过新建、募捐或者其它方式来筹措房源，专门面向中低收入群体进行出租的社会保障性住房。
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